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El software para este sistema se edito en cartuchos, cintas de casetes y disquetes.Algunos de los programas publicados estaban programados en ATARI BASIC, y se editaban en cajas de cartón. Algunas con tamaños descomunales para lo que se alojaba dentro.
Posteriormente aparecieron en cajas de tamaño normal.
A destacar que el tiempo de carga de las cintas es descomunal, pudiendo tardar más de 10 minutos en cargar un triste juego.
Otro de los fomatos habituales es el cartucho. En el sistema ATARI 400/800 implica sacar el cartucho del BASIC para hacerlos funcionar, pero a partir de los sistemas XLy XE, como el BASIC es interno, al insertar un cartucho lo deshabilita.
Para terminar, también se publicó software en disquet, pero como de costumbre por aquí no debía aparecer gran cosa, como ya pasaba con el Commodore 64.